软件资源

1、系统软件资源

类别

型号

操作系统

底层 Ubuntu 18.04,业务层可支持Linuxwindows各发行版本。

作业调度

Slurm

Intel C/C++/Fortran编译器

Intel MKLBLASLAPACKFFTW

并行环境

Intel MPIOpenMPI

GPU环境

GPU容器、GPU虚拟化

2、应用软件资源

序号

软件名

版本

简介

部署环境

1

JupyterLab python

1.1

3.10-3.6

Jupyter Notebook 的本质是一个 Web 应用程序,便于创建和共享程序文档,支持实时代码,数学方程,可视化和 markdown 用途包括:数据清理和转换,数值模拟,统计建模,机器学习等等

实例

2

RRStudio

4.2,4.2.2

R 提供数据挖掘和分析功能,提供统计和制图技术,包括线性和非线性建模,经典的统计测试,时间序列分析、分类、收集等。

RStudio是为R语言设计的一种跨平台集成开发环境.

实例

3

Pytorch

1.8.2

PyTorch是一个开源的Python机器学习库,基于Torch,用于自然语言处理等应用程序

实例

4

TensorFlow

2.8

TensorFlow是谷歌基于DistBelief进行研发的第二代人工智能学习系统,其命名来源于本身的运行原理。Tensor(张量)意味着N维数组,Flow(流)意味着基于数据流图的计算,TensorFlow为张量从流图的一端流动到另一端计算过程。

实例

5

Gaussian

16

Gaussian软件是目前化学领域最流行、应用范围最广的商业量子化学计算程序包

实例

4

GROMACS

2016.3

GROMACS是一个功能强大的分子动力学的模拟软件,其在模拟大量分子系统的牛顿运动方面具有极大的优势。GROMACS是用于研究生物分子体系的分子动力学程序包。

集群

5

NAMD

2.12

NAMDNAnoscale Molecular Dynamics)是用于在大规模并行计算机上快速模拟大分子体系的并行分子动力学代码。

集群

6

Amber

分子动力学软件

集群

7

MATLAB

2022a

MATLAB是美国MathWorks公司出品的商业数学软件,用于算法开发、数据可视化、数据分析以及数值计算的高级技术计算语言和交互式环境

实例/集群

8

simulia

2022

SIMULIA达索为多学科和多领域的科学计算和工程仿真提供商业软件平台。

集群

9

VASP

5.4

VASP是维也纳大学Hafner小组开发的进行电子结构计算和量子力学-分子动力学模拟软件包。它是材料模拟和计算物质科学研究中最流行的商用软件之一。

集群

10

comsol

COMSOL Multiphysics 是以有限元法为基础,通过求解偏微分方程(单场)或偏微分方程组(多场)来实现真实物理现象的仿真,用数学方法求解真实世界的物理现象。

集群

11

lammps

LAMMPSLarge-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator,可以翻译为大规模原子分子并行模拟器,主要用于分子动力学相关的一些计算和模拟工作,

集群

12

ANSYS

2022R1

ANSYS软件是美国ANSYS公司研制的大型通用有限元分析(FEA商业软件,是世界范围内增长最快的计算机辅助工程(CAE)软件,能与多数计算机辅助设计(CADcomputer Aided design)软件接口,实现数据的共享和交换,如Creo, NASTRANAlgorIDEASAutoCAD等。是融结构、流体、电场、磁场、声场分析于一体的大型通用有限元分析软件。

实例

13

Ubuntu

18.04,20.04

Ubuntu是著名的Linux发行版之一,也是目前最多用户的Linux版本

实例

14

CentOS

容器7,虚拟机 7.9

CentOSLinux发行版之一,它是来自于Red Hat Enterprise LinuxRHEL)依照开放源代码规定发布的源代码所编译而成。

实例

15

Docker

20.10

Docker是一个开放原始码的开放平台软体,用于开发应用、交付应用、运行应用

实例

备注

平台根据用户需要部署软件,商用软件需要项目组提供license,单独给项目组授权。